2013年5月2日，中國科學院規劃戰略局發布了“2012年中國科學院科學出版基金科技期刊排行榜”，排行榜顯示，由中國科學院軟件研究所主辦的期刊《軟件學報》在排行榜中位居第7位(三等)，根據規定，前10名期刊將獲得三等基金5萬元的擇優支持，這是《軟件學報》第5次獲得此項基金。

科學出版基金是由中國科學院設立，是為了支持優秀科技書刊出版，繁榮科技出版事業。它對國內外學術交流、為科教興國培養人才、推動科技成果向現實生產力轉化、促進科技進步和國民經濟建設的發展具有深遠的意義和影響。