中國科學院軟件研究所成立于1985年3月，是致力于計算機科學理論和軟件高新技術的研究與發展的綜合性基地型研究所。所址位于北京市海淀區中關村南四街4號（中國科學院軟件園區內）。軟件研究所前身是中國科學院計算技術研究所的軟件研究室；1995年原中國科學院計算中心計算機應用部分并入軟件研究所；2003年1月，軟件園區綜合管理服務中心整建制劃歸軟件研究所管理，形成了現在的軟件研究所格局。